يعتبر مختبر الأحياء المجهرية مختبراً محورياً ومهماً في اختصاص المختبرات الطبية والتشخيصية الخاصة بالأحياء المجهرية إذ تم تجهيز المختبر بأدوات ومعدات متطورة ومتخصصة للتعامل مع الأحياء الدقيقة بأمان ، ويشرف عليها اختصاصيون من حملة الدكتوراه والألقاب العلمية.